1998年后教育体制改革，原国务院许多部委所属高校或被教育部收编，或下放至各省，部委学校快成历史名词。下面有网友提供详细名单，欢迎纠错补充。
原航空航天部高校：
哈尔滨工业大学【985】【211】
北京航空航天大学【985】【211】
西北工业大学【985】【211】
南京航空航天大学【211】
南昌航空学院（南昌航空大学）
沈阳航空学院（沈阳航空航天大学）
郑州航空工业管理学院
原兵器部高校：
北京理工大学【985】【211】
南京理工大学【211】
长春光学精密机械学院（长春理工大学）
华北工学院（中北大学）（原太原机械学院）
西安工业学院（西安工业大学）
沈阳工业学院（沈阳理工大学）
重庆工学院（重庆理工大学）
原电子工业部高校：
电子科技大学【985】【211】
西安电子科技大学【211】
杭州电子工业大学（杭州电子科技大学）
桂林电子工业学院（桂林电子科技大学）
北京信息工程学院（现合并于北京信息科技大学）
原地质部高校：
中国地质大学【211】
长春地质学院（合并入吉林大学【985】【211】）
成都地质学院（成都理工大学）
西安地质学院（更名为西安工程学院，现并入长安大学【211】）
河北地质学院（石家庄经济学院）
原纺织部高校排名：
东华大学【211】
天津纺织工学院（天津工业大学）
苏州丝绸工学院（合并入苏州大学【211】）
西北纺织工学院（西安工程科技学院,西安工程大学）
浙江丝绸工学院（浙江理工大学）
北京服装学院
郑州纺织工学院（中原工学院）
武汉纺织工学院（先后更名武汉科技学院、武汉纺织大学）
南通工学院（原南通纺织学院，现合并入南通大学）
原邮电部高校：
北京邮电大学【211】
南京邮电大学
长春邮电学院（现合并入吉林大学【985】【211】）
重庆邮电学院（重庆邮电大学）
西安邮电学院（西安邮电大学）
原水利电力部高校：
河海大学【211】
武汉水利电力大学（现合并入武汉大学【985】【211】）
华北电力大学【211】
东北电力学院（东北电力大学）
华北水利水电学院(华北水利水电大学)
葛州坝水利电力学院（现合并入三峡大学）
长沙电力学院（现合并入长沙理工大学）
上海电力学院
原石油部高校：
石油大学（中国石油大学）【211】
西南石油学院（西南石油大学）
大庆石油学院（东北石油大学）
西安石油学院（西安石油大学）
江汉石油学院（现合并入长江大学）
抚顺石油学院（辽宁石油化工大学）
江苏石油化工学院（江苏工学院,常州大学）
新疆石油学院（改制为中国石油新疆培训中心）
原化工部高校：
北京化工大学【211】
南京化工大学（现合并入南京工业大学）
郑州工学院（现合并入郑州大学【211】）
青岛化工学院（青岛科技大学）
沈阳化工学院（沈阳化工大学）
武汉化工学院（武汉工程大学）
原煤炭部高校：
中国矿业大学【211】
阜新矿业学院（辽宁工程技术大学）
山东矿业学院（山东科技大学）
西安矿业学院（西安科技大学）
焦作矿业学院（河南理工大学）
山西矿业学院（现合并入太原理工大学【211】）
淮南矿业学院（安徽理工大学）
华北煤炭医学院（华北煤炭医学院将和河北理工大学合并更名为河北联合大学）
河北煤炭建筑工程学院（更名为河北建筑科技学院，现合并入河北工程大学）
中国煤炭经济学院（山东工商学院）
湘潭矿业学院（合并入湖南科技大学）
黑龙江矿业学院（黑龙江科技学院）
淮北煤炭师范学院（淮北师范大学）
原冶金部(含有色总公司)高校大致如下：
北京钢铁学院（现更名为北京科技大学）【211】
东北工学院（现更名为东北大学）【211】【985】
中南矿冶学院（更名为中南工业大学，后并入中南大学）【985】【211】）
西安冶金建筑学院（现更名为西安建筑科技大学）
昆明工学院（现更名为昆明理工大学）
武汉钢铁学院（相继更名为武汉冶金科技大学，武汉科技大学）
鞍山钢铁学院（相继更名为鞍山科技大学、辽宁科技大学）
江西矿冶学院（先后更名南方冶金学院、江西理工大学）
马鞍山钢铁学院（先后更名华东冶金学院、安徽工业大学）
包头钢铁学院（合并于内蒙古科技大学）
青岛建筑工程学院（现更名为青岛理工大学）
河北矿冶学院(相继更名为唐山工学院、河北理工大学)
广东矿冶学院（更名为广东工学院，现合并于广东工业大学）
北京冶金机电学院（现更名为北方工业大学）
桂林冶金地质学院(先后更名桂林工学院、桂林理工大学)
长春师范学院(长春师范大学)
沈阳黄金学院（现合并于东北大学【985】【211】）
原80年代末的机械部（非90年代机械部与兵器工业部合并的机械电子工业部）高校：
吉林工业大学（并入吉林大学【985】【211】）
湖南大学【985】【211】
合肥工业大学【211】
江苏理工大学（原镇江农机学院，现并入江苏大学）
东北重型机械学院（燕山大学）
陕西机械学院（西安理工大学）
上海机械学院（上海理工大学）
沈阳工业大学
武汉汽车工业大学（并入武汉理工大学【211】）
哈尔滨理工大学（原哈尔滨电工学院与哈尔滨科技大学合并）
甘肃工业大学（兰州理工大学）
洛阳工学院（原洛阳农机学院，现合并入河南科技大学）
太原重型机械学院（太原科技大学）
北京机械工业学院（现合并入北京信息科技大学）
湖北汽车工业学院
原交通部高校：
西安公路交通大学（现合并于长安大学【211】）
大连海事大学【211】
武汉交通科技大学（现合并于武汉理工大学【211】）
上海海运学院（上海海事大学）
长沙交通学院（现合并于长沙理工大学）
南通医学院（现合并于南通大学）
重庆交通学院（重庆交通大学）
原轻工业部高校：
无锡轻工业学院（江南大学【211】）
中央工艺美术学院（并入清华大学【985】【211】）
天津轻工业学院（天津科技大学）
西北轻工业学院（陕西科技大学）
北京轻工业学院（合并于北京工商大学）
景德镇陶瓷学院
郑州轻工业学院
大连轻工业学院（大连工业大学）
原铁道部高校：
西南交通大学【211】
北方交通大学
北京交通大学【211】
长沙铁道学院（现合并入中南大学【985】【211】）
上海铁道大学（由上海铁道学院与上海铁道医学院合并，现合并入同济大学【985】【211】）
大连铁道学院（大连交通大学）
兰州铁道学院（兰州交通大学）
南京铁道医学院（现合并入东南大学【985】【211】）
华东交通大学
石家庄铁道学院（石家庄铁道大学）
苏州铁道师范学院（合并于苏州科技学院）
原建设部高校：
哈尔滨建筑大学（合并于哈尔滨工业大学【985】【211】）
重庆建筑大学（合并于重庆大学【985】【211】）
沈阳建筑工程学院（沈阳建筑大学）
西北建筑工程学院（合并于长安大学【211】）
武汉城市建设学院（合并于华中科技大学【985】【211】）
南京建筑工程学院（合并于南京工业大学）
苏州城市建设环境保护学院（合并于苏州科技学院）
原建材总局高校：
武汉工业大学（现合并于武汉理工大学【211】）
西南工学院（现合并于西南科技大学）
山东建材工业学院（现合并于济南大学）
上海建材学院(合并入同济大学【985】【211】）
原农业部高校：
中国农业大学【985】【211】
南京农业大学【211】
西北农林科技大学【985】【211】
华中农业大学【211】
沈阳农业大学
华南农业大学
东北农业大学【211】
西南农业大学（合并成西南大学【211】）
华南热带作物农业大学（并入海南大学【211】）
上海水产大学（上海海洋大学）
石河子大学【211】
大连水产学院（大连海洋大学）
塔里木农垦大学（塔里木大学）
原林业部高校：
北京林业大学【211】
东北林业大学【211】
南京林业大学
中南林学院（中南林业科技大学）
西南林学院（西南林业大学）
原卫生部(含药监局)高校：
协和医科大学（并入清华大学【985】【211】）
北京医科大学（现合并于北京大学【985】【211】）
上海医科大学（现合并于复旦大学【985】【211】）
中山医科大学（现合并于中山大学【985】【211】）
华西医科大学（现合并于四川大学【985】【211】）
同济医科大学（现合并于华中科技大学【985】【211】）
湖南医科大学（现合并于中南大学【985】【211】）
中国医科大学
白求恩医科大学（现合并于吉林大学【985】【211】）
山东医科大学（现合并于山东大学【985】【211】）
中国药科大学【211】
西安医科大学（现合并于西安交通大学【985】【211】）
沈阳药科大学
原外经贸部高校排名：
对外经济贸易大学【211】
上海外贸学院（上海对外贸易学院,上海对外经贸大学）
广州外贸学院（现并入广东外语外贸大学）
天津外贸学院（现并入南开大学【985】【211】）
原财政部（含中国人民银行）高校：
上海财经大学[财政部直属第一高校]【211】
西南财经大学[中国人民银行直属第一高校]【211】
中南财经大学（合并于中南财经政法大学【211】）
东北财经大学
中央财经大学【211】
陕西财经学院（合并于西安交通大学【985】【211】）
江西财经大学
湖南财经学院（合并于湖南大学【985】【211】）
山东财政学院（合并成山东财经大学）
中国金融学院（与对外经贸大学【211】合并）
原文化部（含广播电影电视总局）高校：
中央音乐学院【211】
中央美术学院
中国美术学院
中央戏剧学院
北京广播学院（中国传媒大学【211】）
上海音乐学院
上海戏剧学院
北京电影学院
中国音乐学院
中国戏曲学院
北京舞蹈学院
原商业部（含供销合作总社）高校排名：
杭州商学院（浙江工商大学）
安徽财贸学院（安徽财经大学）
山西财经大学
黑龙江商学院（哈尔滨商业大学）
北京商学院（合并于北京工商大学）
天津商学院（天津商业大学）
郑州粮食学院（相继更名为郑州工程学院，河南工业大学）
武汉食品工业学院(武汉工业学院）
北京物资学院
南京经济学院（南京财经大学）
重庆商学院（合并于重庆工商大学）
兰州商学院
原体委高校：
北京体育大学【211】
上海体育学院
成都体育学院
武汉体育学院
广州体育学院
沈阳体育学院
西安体育学院
核工业部高校排名:
苏州医学院（现合并入苏州大学【211】）
衡阳矿冶学院（更名为衡阳工学院，现合并于南华大学）
抚州地质学院（相继更名为华东地质学院，东华理工学院，东华理工大学）
原司法部高校排名：
西南政法大学
中国政法大学【211】
华东政法学院(华东政法大学)
中南政法学院（合并于中南财经政法大学【211】）
西北政法学院（西北政法大学）
民航总局直属：
中国民用航空学院(中国民航大学)
审计署直属高校：
南京审计学院
税务总局直属高校：
长春税务学院（吉林财经大学）
外交部直属高校：
外交学院
国家安全部直属高校：
国际关系学院
共青团中央直属高校：
中国青年政治学院
